La congelació o criopreservació d’una mostra de semen o de biòpsia de testicle és una tècnica relativament senzilla en la que s’afegirà a la mostra mig crioprotector i es congelarà amb vapors de nitrogen líquid (-196ºC). Aquest procés es realitza segons diverses indicacions:

1. Casos d'oligoastenoteratospèrmia severa (baix nombre d’espermatozoides i/o  amb poca mobilitat i/o mala morfologia) o períodes d’absència d’espermatozoides a l'ejaculat amb la finalitat de disposar d’un nombre suficient d’espermatozoides mòbils en el moment del seu ús.
2. En patologies uroandrològiques que impliquen dificultats en el coit (malformacions, impotència, etc.).
3. Emmagatzemament d'ejaculats previs a qualcun tractament que pugui comprometre la fertilitat en el futur: vasectomia, tractaments oncològics (quimioteràpia o radioteràpia), etc.
4. Que existeixi dificultat en l’obtenció d’una mostra d'ejaculat.

Les mostres procedents de biòpsia testicular, poden ser utilitzades en fresc i congelar el sobrant per evitar a l’home una nova biòpsia si fos necessari un altre tractament, o directament poden ser criopreservades i descongelades el dia del seu ús.

El nombre de mostres necessàries per assegurar un nombre suficient d’espermatozoides el dia de la descongelació, variarà en funció de la qualitat de cada una d’elles i del tractament indicat.

Els embrions viables d’un cicle de FIV que siguin transferits a l’úter, podran congelar-se per al seu ús posterior. Els possibles destins dels embrions congelats estan especificats a la llei 14/2006 sobre tècniques de reproducció assistida. Els embrions es podran utilitzar durant tot el període reproductiu de la dona.